Un nouveau virus détecté dans des rizières au Burkina Faso

Symptômes du MSV observés en conditions expérimentales. Forte réduction de la croissance des plantes infectées (à gauche), striures sévères sur Oryza sativa (au milieu) et O. glaberrima (à droite).

© IRD – Charlotte Tollenaere

Un virus à la gamme d’hôtes encore plus large que prévu

Cette étude révèle donc que ce virus – connu pour être capable d’infecter de nombreuses graminées et céréales – s’est trouvé un nouvel hôte. Deux souches différentes – infectant le riz en conditions naturelles – ont été identifiées. D’autres analyses moléculaires ont montré que le MSV est très répandu dans les rizières de bas-fond et irriguées de tous les sites échantillonnés (jusqu’à 60% des champs pour les années les plus touchées). De plus, le pourcentage de rizières abritant le virus a clairement augmenté entre 2016 et 2019 sans que l’on sache pour l’instant s’il s’agit de fluctuations ou d’une réelle émergence. « En utilisant des clones infectieux dans des conditions expérimentales à Montpellier, nous avons confirmé la pathogénicité des deux souches de MSV sur les deux espèces de riz », avance Martine Bangratz, ingénieure en virologie moléculaire à l’IRD. Etant donné que le MSV est présent dans les plantations de maïs d’une douzaine de pays africains producteurs de riz, cette nouvelle est inquiétante. Cette surveillance épidémiologique a donc contribué à tirer la sonnette d’alarme vis-à-vis de ce virus potentiellement émergent dans les rizières du continent africain.

Publication : Noun M.I. Fouad, Mariam Barro, Martine Bangratz, Drissa Sereme, Denis Filloux, Emmanuel Fernandez, Charlotte Julian, Nignan Saïbou, Abalo Itolou Kassankogno, Abdoul Kader Guigma, Philippe Roumagnac, Issa Wonni, Charlotte Tollenaere, and Nils Poulicard. 2024. Old foe, new host: Epidemiology, genetic diversity and pathogenic characterization of maize streak virus in rice fields from Burkina Faso. Phytobiomes Journal. https://doi.org/10.1094/PBIOMES-08-23-0085-FI

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